Сен-Пьер и Микелон-это заморская территория Франции, состоящая из восьми островов, расположенных вдоль южного побережья острова Ньюфаунленд. Сен-Пьер был заселен в XVII веке рыбаками, выходцами из Басконии и Бретани.
Плывущий под всеми парусами галеон напоминает о французском исследователе Жаке Картье, который открыл в 1535 году реку Святого Лаврентия. Синее поле символизирует Атлантический океан и небо. В древкой части флага расположены три эмблемы, напоминающие о первых колонистах. На самом верху расположена эмблема Страны басков иккурина-зеленый косой крест на красном поле с наложенным поверх него белым прямым крестом. Бретань представлена горностаевым мехом, а Нормандия-двумя золотыми львами с поднятой правой передней лапой в красном поле.
Флаг утвержден в 1980 году.