15 сентября 1987 г. между СССР и США было подписано Соглашение об учреждении в Москве и Вашингтоне центров по уменьшению ядерной опасности.
Решением правительства СССР от 14 декабря 1987 года Национальный центр по уменьшению ядерной опасности (НЦУЯО) был учрежден при Генеральном штабе Вооруженных Сил.
Первоначально на центр возлагалась задача обмена заблаговременными уведомлениями о пусках баллистических ракет. Однако уже вскоре функции центра в Советском Союзе значительно расширились, и это было связано с подписанием 8 декабря 1987 г. Договора между СССР и США о ликвидации ракет средней и меньшей дальности (Договор о РСМД). Задачи организации и обеспечения контроля за выполнением договора были возложены на центр. С этой целью в его структуре были сформированы инспекционные подразделения, подобран и обучен офицерский состав. Для координации работ по ликвидации ракетных вооружений и обеспечению инспекционной деятельности на объектах РВСН, ВВС и Сухопутных войск в этих видах Вооруженных Сил также были созданы специальные структуры - центры управления ликвидацией (ЦУЛ).
С 24 февраля 1988 г. на специально оборудованном пункте управления НЦУЯО СССР впервые было организовано круглосуточное дежурство. 1 апреля 1988 года вступает в действие прямая линия факсимильной связи национального центра Советского Союза с национальным центром США.