Государственная авиакомпания «223-й лётный отряд» создана на базе 8-й авиационной дивизии особого назначения (8 адОСНАЗ, 8 адон) (аэродром Чкаловский) ВВС России в соответствии с распоряжением президента Российской Федерации от 15 января 1993 года № 37-рп «Об обеспечении деятельности 223 и 224 лётных отрядов Минобороны России» для воздушных перевозок по заданиям президента, правительства и министерства обороны Российской Федерации (Минобороны России).
Официальной датой рождения авиакомпании считается 1995 год, когда авиакомпания была реорганизована в федеральное государственное унитарное предприятие в связи с принятием нового положения о 8 адон и началось выполнение чартерных коммерческих рейсов на самолётах Ил-18, Ил-62, Ту-134,Ту-154 и грузовых рейсов с использованием самолётов Ан-12, Ил-76. В условиях недофинансирования Вооружённых Сил вырученные от перевозок гражданских грузов и пассажиров средства помогали несколько улучшить финансовое положение ВВС.
В 2002 году Минтранс приостанавливал действие сертификата авиакомпании на международные чартерные рейсы в связи с нарушением процедур организации пассажирских перевозок по маршруту Москва (Домодедово) — Хургада. В 2007 году самолётами авиакомпании было перевезено 1,4 % от объёма грузовых перевозок в России.
В 2008 году авиакомпания была названа Генеральной прокуратурой России в числе 38 компаний, имеющих наибольшее количество нарушений требований безопасности полётов.
В 2010 году авиакомпания была преобразована в федеральное государственное казённое учреждение.
16 сентября 2015 года авиакомпания была преобразована в федеральное государственное бюджетное учреждение.
Российской Федерации. Также «флаг» 223-го лётного отряда практически всегда используется для воздушных перевозок за границу в интересах ВВС.
Такой правовой статус двойного подчинения авиакомпании, противоречия в учредительных документах и российском законодательстве, которое запрещает военнослужащим заниматься коммерческой деятельностью, не раз делали авиакомпанию объектом проверок надзорных органов.
После 2010 года выполнение туристических чартерных перевозок за границу прекращено из-за устаревшего для этих целей парка воздушных судов; по России осуществляются в основном вахтовые перевозки нефтегазовых компаний.
Самолёты авиакомпании окрашены в цвета Специального лётного отряда «Россия» (СЛО «Россия») или Аэрофлота СССР. Лётная подготовка личного состава ведётся по планам 8-й авиадивизии особого назначения, в соответствии с регламентами ВВС России. В то же время, 223-й лётный отряд осуществляет пассажирские и грузовые перевозки на внутренних и международных авиалиниях для решения народнохозяйственных задач с соблюдением требований, принятых в гражданской авиации, и под контролем Министерства обороны